248-Forum:Contributing to the iNaturalist codebase

https://forum.inaturalist.org/t/contributing-to-the-inaturalist-codebase/26081
https://github.com/seanclifford/inat-dev-setup
https://ubuntu.com/wsl
https://code.visualstudio.com/docs/remote/remote-overview
https://forum.inaturalist.org/t/using-identify-to-annotate-observations/1417

path to setup a development environment before beginning coding took a bit of time, and isn't super straightforward. I ended up scripting my setup almost completely - in order to share with others and so I could rebuild it quickly if I needed to.

I reckon there's a few others out there who might also be able to contribute, so I thought I'd share how I've set things up to make the path smoother for others to join me.

Before you begin you should take a look at:

My setup scripts

My setup scripts and instructions are here. These will probably only work on Ubuntu - but could probably be used as a guide to setup on macOS. They are mostly scripted versions of what's already in the setup guide linked above.

My setup scripts and instructions are here. These will probably only work on Ubuntu - but could probably be used as a additional guide to assist with setup on macOS. They are mostly scripted versions of what's already in the setup guide linked above.

How I've setup everything else

I'm running Windows 10, so ended up installing Ubuntu (lubuntu distro) on a VM (VirtualBox). I guess I could have attempted using WSL, but I don't trust it to work flawlessly.
The VM is also handy to create snapshots, so when I've hosed my environment, I can revert to a known good version.
I'm currently using up about 35GB of disk space with this setup.

For an IDE, I run Visual Studio Code in Windows with the Remote extension. This allows me to remotely develop on code running in the VM - after setting up a ssh key for the connection.
I have got debugging working remotely, but that took a bit of fiddling around - I can elaborate further if anyone is interested.

From

As well as being able to use a browser in the VM, I've also opened up the 3000 (web) and 4000 (api) ports on my VM so I can browse to my development site from Windows.

If you've got some coding skills, and some spare time, I recommend trying it out!### How I've setup everything else
I'm running Windows 10, so ended up installing Ubuntu (lubuntu distro) on a VM (VirtualBox). I guess I could have attempted using WSL, but I don't trust it to work flawlessly.
The VM is also handy to create snapshots, so when I've hosed my environment, I can revert to a known good version.
I'm currently using up about 35GB of disk space with this setup.

As well as being able to use a browser in the VM, I've also opened up the 3000 (web) and 4000 (api) ports on my VM so I can browse to my development site from Windows.

Met de film van Hilco Jansma was het Jaar van de otter op 2 januari al een succes, de film werd daarna nog twee keer uitgezonden, de laatste keer op Wereldotterdag. De film is inmiddels al door 1,1 miljoen mensen gezien. Inmiddels zijn er ook al twee webinars georganiseerd. Op 12 maart presenteerden Hugh Jansman (WENR) en Céline de Caluwé (WWF België) het verhaal van de otters in Nederland en België. Op 17 mei werd dit gevolgd door een webinar over het oplossen van knelpunten voor otters door Melanie Pekel (Ark Natuurontwikkeling) en Claude Belpaire (Instituut voor Natuur-en Bosonderzoek, België). De webinars zijn terug te kijken: webinar 1 en webinar 2. Er staan nog meer webinars gepland, hou daarvoor Facebook, Instagram en YouTube van CaLutra in de gaten. Achter de social media zit een ongelovelijk enthousiast team van meiden die alles wat nieuwswaardig is over de otter delen op de socials en een website hebben gelanceerd. Elze Polman stuurt dit team aan en zij heeft de otter in allerlei media onder de aandacht kunnen brengen. De meeste terreinbeheerders hebben uitgebreid aandacht besteed aan de otter, zoals Natuurmonumenten, Landschap Overijssel, Fryske Gea en Utrechts Landschap.

Burgers' Zoo lezing "De terugkeer van de otter naar Nederland" - Elze Polman

Burgers' Zoo lezing "De terugkeer van de otter naar Nederland" - Elze Polman
https://wageningen.knnv.nl/video/
https://www.jasjadekker.nl/2016/11/01/vleermuizen-en-verkeer/
RoofVogels Rob Bijlsma
Vlen Vleermuizendag Tilburg 2021

https://beheerdersdag.nl/
https://beheerdersdag.nl/videoregistraties-nu-terug-te-zien/
https://beheerdersdag.nl/terugblik/
https://www.youtube.com/playlist?list=PLg34UN8FwtyqIDaZaO37j_IdMcwl3NVZ8
https://wageningen.knnv.nl/video/
RoofVogels Rob Bijlsma
Vlen Vleermuizendag Tilburg 2021

https://nos.nl/collectie/13871/artikel/2403922-meeste-nederlanders-bezorgd-over-klimaatverandering-weinig-vertrouwen-in-top
e NOS staat vanavond op NPO 1 (20.30 - 21.35 uur) in de live-uitzending Het Klimaat: zijn we te laat? stil bij de vraag hoe het gaat met de aanpak van klimaatverandering en hoe het verder moet. Met uitleg, reportages en bijdragen vanuit de klimaattop in Glasgow. Presentator Winfried Baijens spreekt met onder anderen Diederik Samsom, die medeverantwoordelijk is voor de Europese Green Deal, en omgevingspsycholoog Linda Steg.
https://www.npostart.nl/onze-boerderij/KN_1698945
In Nederland worden jaarlijks zo'n 1,5 miljoen kalfjes geslacht: stierkalfjes en het overschot aan vaarskalfjes die niet op de boerderij kunnen blijven. Het vlees is voornamelijk bedoeld voor de export omdat in Nederland weinig kalfsvlees wordt gegeten. Yvon Jaspers praat met kalverhouders Bert en Trees over hun passie voor de kalveren en het werk op de boerderij. * Boerenzonen Bart en Tom groeien op op het melkveebedrijf van hun ouders in Twente. Wanneer ze naar de Randstad trekken om te studeren zien ze daar hoe de soy-lattes en plantaardige zuivel hun opmars maken. Ze besluiten zelf soja te gaan verbouwen op het land van hun ouders.
https://www.npostart.nl/onze-boerderij/12-12-2021/KN_1727399

https://nos.nl/collectie/13871/artikel/2403922-meeste-nederlanders-bezorgd-over-klimaatverandering-weinig-vertrouwen-in-top

NOS Het Klimaat: zijn we te laat?
Hierna om 17:30: Toen was geluk heel gewoon
https://www.npostart.nl/nos-het-klimaat-zijn-we-te-laat/01-11-2021/POW_05116581
Live informatief programma over de aanpak van klimaatverandering. Deskundigen duiden het veranderende weer in Nederland en er zijn bijdragen van correspondenten over de klimaatverandering in hun land.

De Klimaatkar Tijdens de klimaattop in Glasgow wordt De Hofkar Klimaatkar en staat in het teken van de klimaatcrisis. De vraag of er wel of niet iets aan de hand is zijn we voorbij, over oplossingen valt nog te discussiëren. Rutger Castricum ontvangt in zijn 'taxi' een gast met wie hij de klimaatcrisis bespreekt.

https://www.npostart.nl/blokhuis-extra-de-jaren-80/VPWON_1333136
https://www.npostart.nl/achter-de-dijken/KN_1692780
https://www.npostart.nl/toppop3/POMS_S_AVRO_119896
FoodBlogger Leonie Harm Edens
https://www.npostart.nl/wandelhart/KN_1726325
https://www.npostart.nl/pavlov/POMS_S_NTR_124518
https://www.npostart.nl/zembla/04-11-2021/BV_101405034
https://www.npostart.nl/de-nationale-natuur-quiz/VARA_101379388
Zembla de verloren orka
https://www.npostart.nl/de-diwali-show/14-11-2020/VPWON_1323131
https://www.npostart.nl/dannys-wereld/04-11-2021/VPWON_1332342
https://www.npostart.nl/atlas/03-11-2021/VPWON_1328196
https://www.npostart.nl/de-diwali-show/04-11-2021/VPWON_1333797
https://www.vrt.be/vrtnu/a-z/le-jardin-extraordinaire/4/le-jardin-extraordinaire-s4a10-bali-l-ile-des-macaques-sacres/#
https://fr.wikipedia.org/wiki/Le_Jardin_extraordinaire_(%C3%A9mission_de_t%C3%A9l%C3%A9vision)
https://www.nieuweoogst.nl/nieuws/2021/04/21/kweekvlees-heeft-een-keerzijde
https://nl.wikipedia.org/wiki/Louise_Vet
https://nl.wikipedia.org/wiki/Andrej_Sacharov
https://lobkefaasen.nl/podcast/13-ooit-aten-we-dieren-met-roanne-van-voorst/
Een jonge Russische plantkundige, Nikolaj Vavilov, raakt in de onherbergzame valleien van Centraal-Azië gefascineerd door wilde tarwe. De sleutel tot verbetering van de landbouw, vooral voor de arme Russische boeren, ligt in zijn baanbrekende idee van kruisingen met wilde exemplaren. Op vijf continenten jaagt Vavilov op planten om de grootste collectie zaden ter wereld op te bouwen. Maar in Rusland zijn intussen de communisten aan de macht gekomen en met hen een dodelijke mix van ideologie, fraude en pseudowetenschap. Vavilovs tegenspeler is Trofim Lysenko, die wetenschappelijke wonderen belooft en door Stalin wordt gebruikt om onmogelijke hervormingen door te drukken. In De plantenjager uit Leningrad, de eerste historische roman van Louise O. Fresco, volgen we de hoop en wanhoop van een gedreven wetenschapper, tot Stalins net zich om hem sluit. Het is een aangrijpende geschiedenis van eerlijkheid en moed van een man die werkelijk heeft bestaan en die zich in veel opzichten kon meten met Darwin en Mendel. Zijn werk is vandaag de dag even relevant als in zijn eigen tijd. Louise O. Fresco (1952) is schrijver, wetenschapper en columnist voor NRC Handelsblad. Zij publiceerde eerder onder andere Hamburgers in het paradijs en de romans De kosmopolieten, De utopisten (shortlist Libris Literatuur Prijs) en De idealisten. Over De kosmopolieten: ‘Prachtige beelden, fraai geformuleerde mijmeringen over de werking van het geheugen, de zin van het leven en de rol daarin van het toeval en van doelbewuste keuzes. Een rijke, veelzijdige en goed geschreven roman.’ Elsbeth Etty, NRC Handelsblad Over De utopisten: ‘Fresco stelt een uitermate relevant thema aan de orde: het gebrek aan durf in een politieke praktijk die verlamd lijkt door de grote, actuele uitdagingen van ecologie, migratie en mondialisering. (...) In haar indrukwekkende compositie koos Fresco voor een beheerste, registrerende stijl waarin de goed getypeerde figuren een eigen stem kunnen krijgen.’ Juryrapport Libris Literatuurprijs ‘Kritisch cartografeert ze hun werdegang: vooral het menselijk mengsel van Michiels activisme, opportunisme en behaagzucht is raak. Hij belichaamt als het ware de hoofdloop van zijn generatie: van links activist tot maatschappelijk succesnummer.’ Rob Schouten, Trouw Over De idealisten: ‘Groots, zintuiglijk, word je een universum in geslingerd op een manier waarop natuurdocumentaires dat niet kunnen. Wie zo kan schrijven heeft mij te pakken.’ De Groene Amsterdammer ‘Fresco toont in deze ideeënroman op doorwrochte en uiterst serieuze wijze aan dat “goed doen” zo makkelijk nog niet is.’ De Volkskrant ‘Een bijzonder meeslepende roman, die hoofd én hart prikkelt.’ HP/De Tijd
ISBN:9789044649475
https://www.allesoverboekenenschrijvers.nl/louise-o-fresco-de-plantenjager-uit-leningrad/louise-o-fresco-de-plantenjager-uit-leningrad-recensie/
https://www.podbean.com/ew/pb-b268i-c3003a

https://lobkefaasen.nl/podcast/13-ooit-aten-we-dieren-met-roanne-van-voorst/
Roanne van Voorst is schrijver, journalist en antropoloog. Ze heeft 12 jaar lang onderzoek gedaan naar de sociale impact van klimaatverandering en heeft voor deze onderzoeken geleefd op plekken waar mensen nu al met de gevolgen te maken hebben. Zo leefde ze voor lange tijd in Groenland bij een jagersgemeenschap en later in een sloppenwijk in Jakarta.
https://podcastluisteren.nl/ep/De-Correspondent-Ooit-aten-we-dieren-met-Roanne-van-Voorst
De afgelopen jaren is ze zich meer en meer gaan verdiepen in wat er nodig is om een klimaatcatastrofe te voorkomen en zo kwam het onderwerp dieren en bijproducten van dieren eten op haar pad. Ze schreef er zelfs een boek over: Ooit aten we dieren. Een boek waarin ze uiteenzet waarom de komende generaties met verbazing gaan terugkijken op de manier waarop ‘wij’ dieren behandelden, zelfs toen al lang bekend was dat dieren hieronder lijden en de productie van dierlijke producten een enorme bijdrage levert aan klimaatverandering.

In deze aflevering praat ik met Roanne verder over haar onderzoek naar de sociale impact van klimaatverandering en het toekomstscenario van de bioindustrie. Ze vertelt o

https://drive.google.com/file/d/1DakXcuYxoB_QawdXMx8N-T7zwOD-KI7V/view

The event will focus on the most recent regional climate information for the North and Central America region based on the latest IPCC WGI AR6 relevant for impact and risk assessment. The climatic impact-drivers (CIDs) framework will be introduced and future projection of the most relevant CIDs, with their past trend observations and attribution will be highlighted for each of the 8 AR6 subregions of North and Central America. The events will be enriched by examples of CID projections at several global warming levels (1.5oC, 2oC and 4oC) illustrated by mean of the Interactive Atlas facility. The plenary discussion will be followed by a Q&A session in separated breakout rooms where specific topic in different
languages will be discussed with the participants
Regional climate information: Climate change in North and Central America

Regional climate information: Climate change in North and Central America

Removed EOL in October 2021 as external name provider due to continuing import errors, too many issues caused by using EOL (ungrafted taxa, authors being included in names, etc), which curators had to clean up, and that it was creating more issues than it solved.
Catalogue of Life was the second possibility to import taxa, now the only one:

Catalogue of Life’s 2012 is the only remaining external name provider. No plans to add more.
That option hasn’t shown photos for any taxon since the connection broke from the EOL facelift in spring 2018, as far as I know.
https://forum.inaturalist.org/t/eol-content-error-on-guides/4857/2

This *EOL v3 web services API is in its infancy*. So it need more suggestions.See whether it helps you:
About the web services API EoL did a complete site redesign about a year ago, and as you note that since guides are abandoned it was not fixed.
Maybe it’s related to not being able to pull taxon photos from EOL after they changed their site?

See here (end of last year, pre Discourse):
https://groups.google.com/forum/#!searchin/inaturalist/EOL|sort:date/inaturalist/QVJiUMAd-qQ/FmjmrWOjAQAJ

https://groups.google.com/forum/#!topic/inaturalist/79w-upMACYs

(it also happened in April/May 2018, but was fixed. As far as I know, the November/December issue with EOL photos is ongoing)

Sanne Spinoza Klokhuis Filosofie met haar leerlingen

Rapport Paddepoelsterweg KNNV 2001 Sprikkenburg Zernike by Andre Srepsoh on Scribd

https://geo.noorderzijlvest.nl/Geoweb/index.html?viewer=Waterschapskaart.Waterschapskaart
RoegebosSloot, KoiterSloot, Oude GrieteTocht, GrieteTocht, MErodeGraft, RoegeBosTocht, OUde Held TOcht, KliefDiep
https://geo.noorderzijlvest.nl/Geoweb/index.html?viewer=Waterschapskaart.Waterschapskaart
https://vianatura.nl/ Wat landschap betekent voor mensen heeft altijd een eigen kleur. Voor de liefhebber, de agrariër, de ecoloog, de kunstenaar, de natuuractivist, de bestuurder, de ondernemer en het kind.
https://geo.noorderzijlvest.nl/Geoweb/index.html?viewer=Waterschapskaart.Waterschapskaart

Our Planet Now: COP26
Tackling climate change: How far will you go?
https://www.bbc.co.uk/sounds/podcasts

https://www.waternetwerk.nl/knw-activiteiten/405-wok-2021 de week van 15-19 november dagelijks een webinar van 15:30-17:00 uur. Door de Themagroep Waterkwaliteit @Waternetwerker
VANDAAG: de Nederlandse KRW-aanpak in Europees perspectief, MORGEN: verwijdering van microverontreinigen - M. Bentvelzen Unie van Waterschappen (Dutch Water Authorities), R. Koopman RIVM National Institute for Public Health and the Environment https://www.waternetwerk.nl/knw-activiteiten/405-wok-2021

ma 15 nov | Halen we de KRW doelen?
Ondanks omvangrijke maatregelpakketten en state-of-the-art doelen wijzen verschillende analyses er op dat we in Nederland de KRW-doelen in een deel van onze wateren in 2027 niet halen. Wat is er aan de hand? Is ons watersysteem zo van slag dat het nog decennia duurt voordat dit zich in voldoende mate heeft hersteld? Of zijn we gewoon veel te kritisch en mogen we niet klagen over de huidige waterkwaliteit? Hoe ligt dit eigenlijk in andere Europese landen? Kunnen we in Nederland wat leren van de wijze waarop zij met het doelbereik 2027 omgaan? Twee experts geven hun visie op de toekomst van de Nederlandse waterkwaliteit en zetten de Nederlandse aanpak in Europees perspectief. Aansluitend gaan wij met hen in debat.

di 16 nov | RWZI lozingen in relatie tot KRW-opgaven
Veel rioolwaterzuiveringen zullen de komende decennia worden verbeterd. Waterschappen beogen hiermee ook medicijnresten en andere opkomende stoffen te verwijderen. De eerste zuivering die full-scale microverontreinigingen gaat zuiveren wordt dit najaar in gebruik genomen en ook andere RWZI’s zullen de komende decennia worden verbeterd. Vragen die spelen zijn in hoeverre met de beoogde verbetering voldaan kan worden aan de KRW-opgaven in het waterlichaam waarop wordt geloosd en/of benedenstrooms wordt afgewenteld? Hoe bepaal je de effectiviteit met chemische en biologische methoden? Wat wordt ‘geleerd en geïmplementeerd’? In dit webinar zullen de successen maar ook de uitdagingen worden gepresenteerd en bediscussieerd.

wo 17 nov | Tools voor regio-specifieke landbouwmaatregelen
De diffuse nutriënten uit- en afspoeling van landbouwpercelen naar water vormt nog steeds voor veel waterlichamen een belemmering om de KRW-doelen te halen. Lokale omstandigheden bepalen de noodzaak voor reductie en het effect van maatregelen. De laatste jaren zijn tools ontwikkeld die lokaal (op een bedrijf / perceel) inzicht geven welke maatregelen effectief zijn. Een die in de picture staat is de tool 'Maatregelen op de Kaart', maar er zijn er (veel) meer. Dit webinar biedt een overzicht en bediscussieert mogelijkheden om tools te bundelen, uniformeren, integreren, en verdere ontwikkeling (beter) te stroomlijnen en organiseren.

do 18 nov | Ecologische ontwikkeling van het IJsselmeergebied
De Marker Wadden halen regelmatig het nieuws, de eilanden en hun omgeving worden goed bezocht door vogels en vissen, en nieuwe eilanden worden op dit moment aangelegd. Maar wat gebeurt er allemaal nog meer in het IJsselmeergebied? Welke ontwikkelingen vinden plaats, welke ideeën en plannen zingen rond en welke doelen zouden we moeten nastreven? In dit webinar komt een aantal onderzoekers aan het woord die betrokken zijn bij de activiteiten in het IJsselmeergebied.
https://www.waternetwerk.nl/wat-we-doen/webinars-events/402-webinars-waterkwaliteit-op-de-kaart-2021

vr 19 nov | Verantwoord waterplezier en -vertier?
Bij mooi weer zoeken mensen graag het water op en kunnen velen de verleiding niet weerstaan om te gaan pootje baden of zwemmen. Er is veel vraag naar plekken waar dat kan, zoals strandjes of waterspeeltuinen, en de aanleg daarvan trekt weer meer mensen aan. Daarnaast zijn 'city swims' en 'mud runs' heel populair. De activiteiten op of rond het water blijven niet altijd beperkt tot aangewezen zwemwateren waar de kwaliteit regelmatig wordt gecontroleerd. We gaan kijken wat er bekend is over de risico’s van dergelijke activiteiten. Dat roept natuurlijk de vraag op wat er aan te doen valt, enerzijds om risico’s voor de gebruikers in beeld te brengen en anderzijds welke maatregelen mogelijk zijn om risico’s te verminderen. En hoe stimuleer je dat gebruikers voor zichzelf een goede afweging maken?

https://www.waternetwerk.nl/wat-we-doen/webinars-events/402-webinars-waterkwaliteit-op-de-kaart-2021
Webinar Waterkwaliteit
https://www.helpdeskwater.nl/onderwerpen/wetgeving-beleid/delta-aanpak/
https://agrarischwaterbeheer.nl/nieuws/voortgang-en-effect-van-het-deltaplan-agrarisch-waterbeheer-zichtbaar-maken
https://www.agrarischwaterbeheer.nl/
samenmeettools zijn nog heel beperkt beschikbaar. denk aan ScanjeSloot, NitraatApp, handheld sensoren
https://www.tauw.nl/projecten/sken-je-sloot.html https://www.agv.nl/onze-taken/schoon-water/waterkwaliteit-meten/sken-je-sloot-boeren-meten-eigen-sloot/ https://www.h2owaternetwerk.nl/h2o-actueel/akkerranden-drenthe-en-groningen-ingezaaid-voor-schoner-water

Gaat niet zo goed met de jongeren in VK: hIk was onder de indruk van het onderdeel 'Verenigd Koninkrijk'' https://www.npostart.nl/how-to-be-young/KN_1726127

Gaat niet zo goed met de jongeren in VK: hIk was onder de indruk van het onderdeel 'Verenigd Koninkrijk'' https://www.npostart.nl/how-to-be-young/KN_1726127
https://nietbangvoorwater.info/zuid-holland-watersnood/
https://www.hhdelfland.nl/over-ons/erfgoed/gedenkteken/
https://app.nlziet.nl/live/sbs9
https://www.zonerama.com/TheoHeijmans/Album/5098659
https://www.zonerama.com/TheoHeijmans/ NJN Technische fotos planten Flickr
https://stinzenflora-monitor.nl/
https://www.nhnieuws.nl/nieuws/293909/vrouwen-jarenlang-in-ongewisse-door-onverklaarbare-klachten-meer-onderzoek-nodig%20
https://www.vpro.nl/programmas/geen-kleine-man.html

Posted on November 9, 2021 10:20 PM by

ahospers

248-Forum:Contributing to the iNaturalist codebase

Before you begin you should take a look at:

My setup scripts

How I've setup everything else

Comments

Add a Comment